在巴苏陀人割让给自由邦的地区内的法国新教和英国美以美会的教堂被关闭在英国和法国都激起了对布尔人的许多恶感。这种愤慨的情绪恰好又与日益增长的、生怕自由邦会把疆界再往前推进，以便在东海岸得到一个海港的忧虑同时出现。由于对那些协定及协定所赋予这些共和国的自主感到不满，帝国政府改变了过去的立场，决定在原则上接受莫舒舒的提议。于是沃德豪斯受权根据下述含义明确的条件来合并巴苏陀兰，即对巴苏陀兰未来政府的组织和经费不是由英国政府，而是由纳塔尔负责。这个决定受到沃德豪斯的强烈指责，他“不信任谢普斯通的土著政策，并对纳塔尔议会中关于要向巴苏陀人征税以增大纳塔尔细微的收入，以及要把巴苏陀兰的某些部分留出来作白人的居留地的议论深感不安”。

这时，布尔人唯恐受骗上当而失掉胜利，就急忙向巴苏陀人仅有的最后一个据点希姆高原发动一次大规模的进攻。这个行动迫使英国人迅速采取措施。1866年3月12日沃德豪斯宣布“巴苏陀人的部落不管从那个意义上说都应被视为英国的臣民，这个部落的领土也应被视为英国的领土”。接着又决定，这块领土暂时将由高级专员管理，而不是象原先计划的那样与纳塔尔殖民地合并。国务大臣在写给高级专员的信中把这种将长期代表着英国对这块领土所采取处理方式的帝国政府的态度概括为:“〔保护巴苏陀人的〕目的是要实现这样一种安排:应确保南非各殖民地边境地带的和平，但并不使帝国政府承担任何债务……”。开普殖民地的议员们严厉地指责帝国政府采取这种以他们的重大利益为代价的节约政策。

1868年3月12日的公告虽然明确地向巴苏陀人提供了英国的保护，但并未解决自由邦与巴苏陀人之间的边界问题。因而，高级专员就开始通过谈判以收回部分已交出去的耕地，并通过缔结条约以建立边界。由于认识到英国吞并巴苏陀兰已无可挽回，自由邦最后于1869年2月12日签署了北阿利瓦尔条约，据此，卡勒登河以东的土地归还给了巴苏陀人。但是曾充满信心，预期能收复他们全部土地的巴苏陀人所得到的土地仅仅够使他们免于遭受最难忍的拥挤之苦。他们失去了许多最好的牧地和耕地，这不仅可以从他们开始发展一种农业比畜牧业更为显著的经济这一事实看出来;而且尤其可以从他们开始用为白人服务挣得的工资来补助他们的生产这一事实看出来。当时划定和得到认可的边界与今天公认的边界大体上是一样的。

英国政府不久就被发现对它在巴苏陀兰所承担的新义务并不怎么热心，对那里的行政管理似乎既没有时间，又缺乏经费。而且，殖民部尚未认真考虑将大片的黑非洲地区置于它的直接管理之下，而已有的这种直接管理一般仅限于沿海城市及其邻近地区。因为兼并巴苏陀兰显然出于确保开普殖民地和纳塔尔的各边境地区的和平的需要，所以上述两殖民地中的一个应该承担行政管理的责任，这似乎是理所当然的。因此，使巴苏陀兰成为一个直辖的保护国的初步安排只不过是暂时的和探索性的，莫舒舒死后将会有变化。